Zaman Sengoku yang penuh kekacauan menjadi latar kelam di mana seorang penguasa tamak membuat perjanjian dengan iblis demi kemakmuran negerinya. Akibatnya, sang anak lahir tanpa anggota tubuh dan organ, kemudian dibuang begitu saja ke sungai demi keselamatan.
Bayi malang itu ditemukan oleh seorang dokter jenius bernama Jukai, yang kemudian memasang prostetik kayu untuknya. Ia tumbuh menjadi pendekar tangguh yang memburu para iblis demi merebut kembali bagian tubuhnya yang dicuri oleh para siluman kejam.
Di tengah perjalanan, ia bertemu dengan Hyakkimaru, pemuda dingin dengan pedang tersembunyi yang bertekad memulihkan kemanusiaannya. Kehadiran sosok ini perlahan mengubah cara pandangnya terhadap dunia yang penuh dengan kekejaman serta pengkhianatan.
Tak lama kemudian, muncul Dororo, bocah yatim piatu yang lincah dan berani. Mereka berdua membentuk ikatan unik; sang bocah menjadi pemandu bagi pendekar yang tak bisa melihat atau mendengar ini, memberikan warna baru di tengah pengembaraan yang berdarah.
Keduanya terjebak dalam dilema moral yang berat saat harus memilih antara menyelamatkan diri sendiri atau mengorbankan kedamaian negeri yang penuh penderitaan. Sebuah perjalanan emosional tentang pencarian jati diri di tengah dunia yang tak mengenal belas kasih.
Zaman Edo yang kejam menjadi saksi bisu perjuangan seorang pelarian yang diburu tanpa ampun oleh bekas klan ninja asalnya. Dalam balutan genre aksi sejarah yang kelam, ia harus bertahan hidup di dunia yang penuh pengkhianatan dan penuh dengan tipu muslihat.
Sosok Kamui merupakan seorang pengembara tangguh yang terpaksa membuang masa lalunya demi kebebasan. Kekuatan luar biasa dan teknik bela diri tingkat tinggi membuatnya tetap hidup meski maut selalu mengintai di balik bayangan setiap langkah kakinya.
Hubungan penuh ketegangan terbangun saat Hanbei, seorang pria yang berusaha mencari arti keberadaan di tengah penindasan, bersinggungan dengan sang ninja. Kehadirannya memicu dilema moral tentang apakah loyalitas sejati masih ada di dunia yang rusak ini.
Konflik utama meledak ketika para pembunuh bayaran dikirim untuk memburu setiap orang yang pernah berinteraksi dengannya. Sugaru, seorang kunoichi misterius, terjebak di antara tugas mematikan dan simpati yang perlahan tumbuh terhadap sang target utama.
Menembus batas moralitas, ia terus berlari sambil menantang hukum alam dan takdir yang ingin mengekangnya. Inilah perjalanan epik tentang kesepian, harga sebuah kebebasan, dan pertarungan brutal demi mempertahankan eksistensi di dunia yang penuh kebencian.
