Fasilitas laut canggih bernama Pacific Buoy menjadi pusat perhatian setelah terhubung dengan kamera keamanan di seluruh dunia. Konflik memuncak saat teknologi pengenalan wajah milik **Ai Haibara** terancam dibobol, memicu bahaya besar bagi identitas aslinya.
Organisasi Hitam yang dipimpin oleh **Gin** segera bergerak untuk menculik teknisi kunci, memicu perburuan di tengah laut yang mencekam. Situasi berubah menjadi pertaruhan nyawa yang intens ketika rahasia gelap di balik teknologi tersebut mulai terbongkar.
Conan Edogawa harus berpacu dengan waktu untuk menyelamatkan rekannya dari kejaran para pembunuh dingin. Hubungan emosional yang kuat antara keduanya menjadi poros utama, di mana ketakutan akan masa lalu kembali menghantui sang ilmuwan jenius tersebut.
Di sisi lain, **Akai Shuichi** memantau situasi dari balik layar dengan strategi taktis, sementara **Amuro Tooru** harus menyusup demi mengumpulkan intelijen krusial. Ketegangan antar agen rahasia pun tak terelakkan di bawah bayang-bayang kapal selam misterius itu.
Pertarungan epik di kedalaman samudra menjadi pembuktian loyalitas dan keberanian bagi para detektif. Akankah identitas mereka tetap tersimpan rapi, ataukah teknologi mutakhir ini justru menjadi akhir dari segalanya? Sebuah konfrontasi tak terelakkan telah menanti.
