Dunia berubah total setelah bencana besar membangkitkan ras Shadow Angels dari tidur panjang mereka. Manusia yang tersisa harus bertahan hidup dari serangan makhluk bersayap tersebut menggunakan teknologi kuno. Perang sengit pun pecah demi masa depan umat manusia.
Seorang pemuda bernama Apollo muncul sebagai sosok penyelamat dengan kekuatan misterius yang tak terduga. Ia bertemu dengan Silvia de Alisia, seorang gadis bangsawan yang sangat keras kepala namun memiliki tekad luar biasa dalam pertempuran.
Mereka bergabung dengan tim elit pilot untuk mengendalikan Aquarion, robot legendaris yang hanya bisa digerakkan oleh elemen terpilih. Hubungan mereka diuji karena perbedaan kepribadian yang tajam, menciptakan ketegangan intens di balik kemudi mesin perang tersebut.
Pierre Vieira hadir sebagai sosok rekan yang penuh semangat dan selalu memicu konflik di dalam skuad. Kerja sama tim menjadi kunci utama, namun ego dan rahasia masa lalu sering kali menghalangi sinkronisasi mereka saat menghadapi ancaman dari angkasa.
Saat musuh semakin kuat, para pilot dipaksa menyatukan hati dan jiwa dalam harmoni sempurna. Inilah kisah tentang cinta, pengorbanan, dan takdir yang terjalin dalam pertempuran kosmik untuk menyelamatkan dunia dari kehancuran total yang mengintai setiap saat.
Dunia berada dalam ancaman entitas dimensi lain yang menculik manusia untuk kebutuhan energi mereka. Di tengah kekacauan ini, sebuah akademi militer rahasia melatih pilot muda untuk mengendalikan robot purba raksasa demi menahan serangan musuh yang tak henti membombardir.
Amata Sora adalah remaja laki-laki pemalu yang menyembunyikan kekuatan terbang misterius. Hidupnya berubah drastis saat ia bertemu dengan gadis dingin bernama Mikono Suzushiro, yang merasa tidak memiliki bakat apa pun di tengah rekan-rekan elit lainnya.
Ketertarikan instan di antara mereka memicu aktivasi robot legendaris Aquarion. Namun, hubungan mereka terhambat oleh peraturan ketat Neo-DEAVA dan kehadiran Kagura Demuri, sosok liar yang sangat terobsesi pada Mikono hingga memicu konflik batin yang dalam.
Ketegangan meningkat ketika takdir masa lalu mulai terkuak melalui elemen cinta yang terlarang. Zessica Wong, rekan satu tim mereka, justru terjebak dalam cinta segitiga yang rumit, memberikan bumbu drama emosional di tengah pertempuran robot yang sangat intens.
Pertarungan melawan musuh dari Altair menuntut penyelarasan emosi yang sempurna antar pilot. Mereka harus menghadapi trauma dan keinginan pribadi demi mencapai koneksi spiritual yang lebih tinggi, demi melindungi masa depan umat manusia dari kepunahan total.
Dunia pasca-apokaliptik kembali terancam saat sisa-sisa entitas kuno bangkit dari tidur panjang mereka. Dalam kekacauan ini, teknologi purba bernama Aquarion menjadi satu-satunya harapan bagi umat manusia untuk melawan kehancuran yang sangat nyata.
Apollo hadir sebagai sosok liar yang terobsesi dengan insting bertahan hidup. Pertemuannya dengan Silvia menciptakan percikan konflik intens karena perbedaan prinsip, namun mereka ditakdirkan untuk menyatu dalam kokpit robot raksasa ini.
Hubungan di antara para pilot mulai memanas saat mereka harus memikul beban takdir yang berat. Tekanan mental menguji kesetiaan dan empati, memaksa setiap karakter menghadapi sisi gelap masa lalu demi menyelaraskan energi mereka dalam medan perang.
Konflik batin terus menghantui saat mereka menyadari bahwa kekuatan Aquarion membutuhkan pengorbanan emosional yang besar. Kecurigaan muncul di antara kru, menciptakan jurang pemisah yang berbahaya di tengah gempuran musuh yang semakin cerdik dan mematikan.
Apakah mereka mampu menyatukan hati sebelum semesta benar-benar runtuh? Pertarungan epik ini bukan sekadar adu kekuatan mesin, melainkan perjalanan pencarian jati diri, cinta, dan pemahaman tentang makna keberadaan manusia yang sebenarnya di ambang kepunahan.
