Jadi, ada karakter namanya Kobato Hanato, dia ini gadis yang super duper polos dan naif banget, kayak baru pertama kali kenal dunia luar. Dia muncul di kota dengan misi rahasia: harus mengumpulkan 'luka hati' orang-orang dan menyembuhkannya di dalam botol ajaib supaya keinginannya bisa terkabul. Saking polosnya, dia sering banget bikin orang di sekitarnya gemas sekaligus bingung sama tingkah lakunya yang nggak nyambung.
Dalam perjalanan misinya, dia ditemenin sama Ioryogi, seekor anjing peliharaan (tapi bentuknya boneka) yang galak banget dan hobinya marah-marah melulu ke dia. Mereka berdua ini benar-benar pasangan yang kontras banget, tapi justru dinamika mereka berdua yang bikin cerita jadi seru. Sambil bantu-bantu di TK Yomogi, dia belajar banyak banget tentang apa itu kasih sayang dan arti menjadi manusia yang sebenarnya.
Semakin hari, Kobato mulai ngerti kalau dunia ini nggak cuma soal keajaiban, tapi juga tentang perasaan tulus. Dia jadi dekat sama banyak orang, termasuk Kiyokazu Fujimoto yang awalnya ketus banget tapi pelan-pelan mulai luluh. Akhirnya, perjalanan dia bukan cuma soal misi pribadinya, tapi tentang bagaimana dia menyentuh hidup banyak orang dan mengubah dunianya sendiri jadi lebih hangat.
