Awas! bisa jadi spoiler
Sebuah petualangan luar biasa dimulai saat liburan santai berubah menjadi misi penyelamatan lintas dimensi. Kekacauan terjadi ketika artefak kuno membawa sekelompok alien ke pulau misterius yang menyimpan rahasia sejarah purba serta kekuatan mistis yang luar biasa.
Sang pemimpin pasukan katak, Keroro, harus memimpin rekan-rekannya melewati rintangan berbahaya. Sifatnya yang ceroboh dan obsesinya pada model kit kini diuji, terutama saat ia menyadari bahwa hubungannya dengan Fuyuki sedang berada dalam posisi sangat kritis.
Di sisi lain, muncul sosok Kikari yang misterius dan memiliki koneksi tak terduga dengan pulau tersebut. Kehadirannya memicu perdebatan sengit di antara para anggota peleton, memaksa mereka untuk memilih antara loyalitas pada misi atau ikatan persahabatan yang kuat.
Konflik memuncak ketika muncul entitas bernama Dark Keroro yang memiliki kekuatan jauh melampaui kemampuan normal. Musuh tangguh ini menantang segala hal yang mereka yakini, memaksa tim untuk menyatukan kekuatan dan mengungkap sisi emosional dari jati diri mereka.
Apakah mereka mampu melewati tantangan ruang dan waktu sebelum semuanya terlambat? Dengan memadukan aksi komedi konyol dan drama yang menyentuh, perjuangan mereka di pulau ini akan menjadi ujian terbesar yang pernah dihadapi oleh pasukan invasi paling tidak kompeten ini.
