Di sebuah desa terpencil yang terisolasi dari dunia luar, lahir sepasang anak kembar yang takdirnya dibedakan oleh siang dan malam. Bertahun-tahun kemudian, si kakak yang bernama Yuru tumbuh jadi pemburu hewan yang andal, sementara adiknya, Asa, malah dikurung di dalam penjara demi ngejalanin tugas khusus yang bikin dia nggak boleh sembarangan ketemu orang.
Tapi pada suatu hari yang keliatannya biasa aja, ketenangan desa mereka langsung hancur total. Sekelompok orang bersenjata yang naik helikopter—yang dianggap warga desa sebagai "naga"—mendadak nyerang desa itu buat nyari Yuru dan ngebantai semua orang dewasa di sana. Pas Yuru buru-buru mau nyelametin Asa buat kabur bareng, dia malah nemu sesosok mayat. Parahnya lagi, cewek yang ngebunuh mayat itu justru ngaku-ngaku sebagai adik kembar kandung Yuru yang asli!
Sebelum Yuru ketangkep sama cewek asing itu, dia untungnya berhasil diselametin sama Dera, orang luar yang emang sering main ke desa mereka. Sialnya, pelarian mereka nggak berlangsung lama sampai akhirnya mereka terpojok. Di situasi hidup dan mati itu, Dera maksa Yuru buat ngasih sesembahan ke dewa desa, yang mendadak memanggil sepasang makhluk gaib (daemon) buat bertarung dan ngebongkar rahasia besar di balik kekacauan ini.
Abis baikan sama Dr. Xeno, impian lama Senkuu Ishigami buat bikin misi luar angkasa ke Bulan akhirnya selangkah lagi beneran terwujud! Sementara Dr. Xeno mulai sibuk ngerancang dan ngebangun mesin roketnya, tim Senkuu terus gas pol keliling berbagai benua dan samudra demi nyari sumber daya penting. Nggak cuma nyari bahan baku, mereka juga sekalian ngebangun infrastruktur rahasia dan membangkitkan seluruh populasi manusia yang masih membatu.
Di sisi lain, sosok misterius "Whyman" masih setia menebar teror dan mengawasi bumi dari kegelapan Bulan. Tapi dengan bersatunya kekuatan dan kejeniusan umat manusia saat ini, tinggal nunggu waktu aja sampai roket mereka kelar buat nyamperin si bos misterius itu.
Senkuu dan kawan-kawan udah siap buat baku hantam langsung sama Whyman demi nyari tahu jawaban dari semua misteri pembatuan yang udah bikin manusia pusing selama berabad-abad. Perjalanan menuju luar angkasa pun dimulai, ini bakal jadi misi paling ber-sains dalam sejarah!
Di zaman koboi Amerika, ada balapan paling gokil sedunia bernama Steel Ball Run. Ribuan peserta ngumpul di San Diego buat nempuh jarak 6.000 kilometer lebih lewat padang tandus ekstrem demi hadiah 50 juta dolar. Karena era kuda udah mau habis, peserta dibebasin pakai kendaraan apa aja buat bertahan hidup nembus rute yang belum dipetakan ini.
Di tengah keramaian, Johnny Joestar—mantan joki kuda yang sekarang lumpuh—datang cuma buat nonton. Tapi, pandangannya berubah pas ketemu peserta unik bernama Gyro Zeppeli yang bawa dua bola besi misterius. Johnny ngeliat Gyro pakai bola itu buat ngeluarin kekuatan aneh saat duel, dan pas Johnny nggak sengaja nyentuh bola besinya, kakinya mendadak bisa gerak lagi setelah dua tahun lumpuh.
Demi nyari tahu rahasia di balik bola besi yang bisa bikin dia jalan lagi, Johnny akhirnya nekat ikut mendaftar jadi peserta balapan. Dari sinilah petualangan aneh bin ajaib Johnny dan Gyro mengarungi daratan Amerika dimulai!