Sebuah narasi fiksi ilmiah tentang perjalanan waktu yang memacu adrenalin dimulai saat konspirasi besar mengancam tatanan dunia. Berbalut misteri thriller yang kelam, eksperimen berbahaya mengubah garis waktu dan menciptakan konsekuensi fatal bagi mereka yang terlibat.
Okabe Rintarou, ilmuwan gila yang eksentrik, tidak sengaja menemukan cara mengirim pesan ke masa lalu melalui ponsel. Bersama rekannya, ia terjebak dalam pusaran kekacauan ruang-waktu yang mulai merobek realitas dan menguji kewarasan mentalnya sendiri.
Makise Kurisu, seorang jenius muda yang skeptis, menjadi sekutu vital dalam memecahkan teka-teki rumit ini. Ketegangan muncul saat mereka berhadapan dengan organisasi rahasia SERN, sementara hubungan keduanya berkembang dari rivalitas menjadi ikatan emosional.
Shiina Mayuri, teman masa kecil yang ceria, mendapati dirinya berada dalam bahaya yang tidak ia sadari. Okabe berjuang keras melindungi orang terdekatnya di tengah ancaman masa depan yang hancur, menghadapi dilema moral berat yang meruntuhkan prinsip hidupnya.
Konflik memuncak saat takdir mulai bermain kejam dengan nyawa manusia sebagai taruhannya. Setiap langkah yang diambil untuk memperbaiki kesalahan justru memperburuk keadaan, menggali tema tentang obsesi manusia yang ingin menantang waktu demi menyelamatkan dunia.
Setelah setahun absen, Shinpachi Shimura balik lagi ke Edo, tapi langsung dibikin kaget setengah mati. Gintoki sama Kagura, partner Yorozuya-nya, berubah jadi orang yang sama sekali beda! Pas Shinpachi lari dari markas gara-gara bingung, dia malah nemuin kalau semua orang di Edo udah berubah total, baik tampang maupun sifat mereka.
Yang paling nggak masuk akal, kakaknya, Otae, ternyata udah nikah sama bos Shinsengumi yang hobi ngintip, Isao Kondou, dan sekarang lagi hamil anak pertama mereka. Karena bingung harus gimana, Shinpachi akhirnya mau diajak gabung ke Shinsengumi sesuai permintaan Otae dan Kondou, tapi di sana dia malah nemuin lebih banyak lagi perubahan aneh di dalam organisasinya.
Untungnya, dia sadar kalau wakil ketua Toushirou Hijikata nggak berubah sama sekali. Akhirnya, Shinpachi sama Hijikata kerja sama buat balikin Edo ke kondisi semula. Dengan bumbu lelucon dewasa, parodi nyeleneh, dan referensi yang nggak tahu malu, Gintama balik lagi ngikutin kekacauan konyol Yorozuya di tengah dunia Edo yang penuh sama alien.
