Dunia modern menyimpan rahasia kelam di balik bayang-bayang, di mana para dewa kecil berjuang demi eksistensi. Mereka hanyalah entitas yang terlupakan, berusaha keras mengabulkan permohonan manusia hanya agar tetap diingat dan terus bertahan hidup di dunia fana.
Yato adalah dewa pengangguran yang tidak memiliki kuil sendiri. Ia menawarkan jasanya untuk menyelesaikan masalah sepele manusia dengan bayaran receh, berharap suatu hari nanti ia bisa menjadi dewa agung yang dihormati dan dipuja oleh jutaan orang.
Hidupnya berubah drastis saat ia menyelamatkan seorang gadis SMA bernama Hiyori Iki dari kecelakaan maut. Kejadian ini membuat jiwa Hiyori sering terlepas dari tubuhnya, memaksanya terikat dengan dunia spiritual yang berbahaya bersama sang dewa ceroboh.
Tak lama kemudian, Yato mendapatkan senjata suci baru bernama Yukine, seorang remaja arwah yang penuh kebencian. Hubungan mereka yang rumit menguji kesabaran satu sama lain, karena perilaku Yukine yang memberontak justru menyakiti kondisi fisik sang dewa.
Ketiganya kini harus menghadapi ancaman roh jahat yang menggerogoti manusia dari dalam. Di tengah konflik identitas dan masa lalu yang kelam, mereka belajar bahwa ikatan tulus adalah kunci untuk melawan takdir tragis yang mengintai di balik setiap doa.