Dunia Gensokyo yang damai tiba-tiba diguncang oleh fenomena aneh yang mengancam keseimbangan spiritual. Di balik pemandangan indah yang memanjakan mata, tersimpan rahasia gelap yang mulai muncul ke permukaan, memaksa para penghuninya berhadapan dengan situasi sulit.
Gadis kuil Reimu Hakurei harus segera bertindak untuk memulihkan keadaan. Dengan kepribadiannya yang santai namun tegas, ia memikul tanggung jawab besar sebagai penjaga batas, meski ia harus menghadapi tantangan berat yang datang dari berbagai arah.
Marisa Kirisame, sang penyihir energik, memutuskan bergabung dalam petualangan ini demi mencari jawaban atas anomali tersebut. Hubungan unik mereka yang penuh canda namun saling percaya menjadi kunci utama dalam menelusuri misteri yang mulai menyelimuti dunia.
Di sisi lain, Yukari Yakumo tampak mengawasi dari bayang-bayang dengan rencana misterius. Kemampuannya memanipulasi celah sering kali membuat rekan-rekannya bingung, memicu konflik batin mengenai siapa sebenarnya sekutu dan lawan di tengah kekacauan ini.
Ketegangan memuncak saat mereka menyadari bahwa akar masalah ini bukanlah sekadar gangguan biasa. Persahabatan dan kekuatan sihir akan diuji habis-habisan demi mempertahankan eksistensi Gensokyo agar tidak runtuh oleh kekuatan asing yang tak terduga dan penuh misteri.
