Abis baikan sama Dr. Xeno, impian lama Senkuu Ishigami buat bikin misi luar angkasa ke Bulan akhirnya selangkah lagi beneran terwujud! Sementara Dr. Xeno mulai sibuk ngerancang dan ngebangun mesin roketnya, tim Senkuu terus gas pol keliling berbagai benua dan samudra demi nyari sumber daya penting. Nggak cuma nyari bahan baku, mereka juga sekalian ngebangun infrastruktur rahasia dan membangkitkan seluruh populasi manusia yang masih membatu.
Di sisi lain, sosok misterius "Whyman" masih setia menebar teror dan mengawasi bumi dari kegelapan Bulan. Tapi dengan bersatunya kekuatan dan kejeniusan umat manusia saat ini, tinggal nunggu waktu aja sampai roket mereka kelar buat nyamperin si bos misterius itu.
Senkuu dan kawan-kawan udah siap buat baku hantam langsung sama Whyman demi nyari tahu jawaban dari semua misteri pembatuan yang udah bikin manusia pusing selama berabad-abad. Perjalanan menuju luar angkasa pun dimulai, ini bakal jadi misi paling ber-sains dalam sejarah!
Tomoya Okazaki dan Nagisa Furukawa akhirnya lulus SMA, dan bareng-bareng mereka ngerasain gimana serunya sekaligus emosionalnya masa-masa pendewasaan. Karena Tomoya sempat bingung nentuin masa depan, dia akhirnya belajar pentingnya kerja keras dan ngerasain banget dukungan dari Nagisa. Berkat dedikasi dan kekompakan mereka, pasangan ini terus berjuang buat ngadepin masalah masing-masing, makin akrab sama teman-teman lama, sekaligus ngebangun hubungan baru.
Waktu juga terus berjalan di Dunia Ilusi. Pas padang rumput mulai kerasa dingin gara-gara musim dingin yang datang, Gadis Ilusi dan Boneka Sampah dihadapkan sama situasi sulit yang akhirnya ngebuka rahasia tentang tujuan asli dunia tersebut.
Perjalanan mereka berdua bener-bener jadi ujian buat hati, nunjukin kalau setiap perjuangan, entah itu di dunia nyata atau dunia fantasi, punya makna mendalam yang bakal ngebentuk masa depan mereka selamanya.
